Thème : Évaluer le caractère saisonnier potentiel de la dynamique du COVID-19 en Afrique : Une étude de modélisation mathématique
Sur une période de trois ans d'infections par le SARS-CoV-2, de nombreux facteurs influents restent flous, notamment sa saisonnalité. Malgré de nombreuses études, les conclusions sur les motifs saisonniers varient dans le temps et l'espace, nécessitant des investigations supplémentaires, notamment en Afrique, où le faible nombre de cas était surprenant, pour éviter un choc sanitaire imminent de la pandémie sur le continent. Cette étude vise à explorer la saisonnalité du SARS-CoV-2 à travers trois zones climatiques. Un modèle SEIR étendu comprenant huit classes : susceptibles (S), susceptibles vaccinés (S), exposés (E), infectieux pré-symptomatiques (Ip), infectieux asymptomatiques (Ia), infectieux symptomatiques (Is), infectieux détectés (Id) et récupérés (R), a été utilisé, avec une saisonnalité intégrée via les taux de transmission en utilisant une contrainte saisonnière sinusoidale. Les amplitudes de saisonnalité ont été estimées pour chaque pays, et un test de Kruskal-Wallis a évalué leurs variations entre les zones climatiques. Une analyse de sensibilité a été utilisée pour évaluer l'impact des amplitudes saisonnières des taux de transmission sur le nombre de reproduction contrôlé en utilisant le Coefficient de Corrélation de Rang Partiel (PRCC). L’'amplitude de la saisonnalité de la transmission asymptomatique est apparue comme le facteur clé favorisant la dynamique de la pandémie, surtout dans les zones tempérées plus froides. Ainsi, dans des scénarios potentiels de réémergence du SARS-CoV-2 dans de telles zones, en plus de l'isolement des cas symptomatiques, prévenir la propagation du SARS-CoV-2 parmi les individus infectieux asymptomatiques par le biais de tests de masse pourrait atténuer significativement les charges de la pandémie, notamment pendant les saisons plus froides. Des stratégies similaires pourraient être bénéfiques sur tout le continent, surtout pendant les périodes froides et pluvieuses.
Mots clés : SARS-CoV-2, modèle SEIR, taux de transmission périodique, zones climatiques.
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